Фильм состоит из 4-х новелл. "Взлетная полоса". Офицеры спецназа - Климентий Платов, позывной "Клим", Яков "Якут" Урманов и Владимир "Док" Вяземский - провожают в аэропорту боевого товарища Виктора Хрусталёва по прозвищу Хруст. Вместе со своей девушкой Леной он собирается лететь в долгожданный отпуск на Кипр. Как только самолет поднимается в небо, четверо афганских террористов, вооруженные водяными пистолетами с кислотой, берут его под свой контроль. "Дыхание пророка". Афганистан. В лаборатории, спрятанной под горой, террористы разрабатывают смертельный вирус под кодовым названием "Дыхание пророка". Разведывательному управлению России становится известно, что боевики ведут работу над новой формой вируса, которая сможет передаваться воздушно-капельным путем. Отряду Клима приказывают проникнуть в лабораторию и похитить вакцину в течении 48 часов, после отведенного срока она будет уничтожена ракетным ударом. "Покушение". В город Оби-Гарм, неподалеку от Душанбе, прибывает афганский бригадный генерал Борзани для переговоров с российским военным ведомством. Неожиданно на командира происходит покушение снайпера, но ему удается уцелеть. Испуганный мужчина не доверяет ни своим, ни таджикским солдатам и просит российскую сторону организовать ему охрану. Начальство поручает эту задачу майору Платову и его бойцам. "Послушник". Климентий Платов вместе со своими товарищами готовится вернуться домой. В составе боевой колонны они отправляются на аэродром, чтобы сесть на самолет до Санкт-Петербурга. Спецназовцев просят подобрать на одном из блокпостов батюшку. В это время чеченские солдаты нападают на заставу. Вовремя подоспевший Клим вместе со своим отрядом уничтожает противника. Виктор Хрусталев узнает в священнике бывшего боевого товарища Александра Орлова, жизнь которого пошла под откос после трагической смерти дочери.

Спецназ 2